Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF6Q13247 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms