Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF5Q13243 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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