Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPS1Q13098 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GPS1Q13098 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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