Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSPB3Q12988 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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