Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TROQ12816 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TROQ12816 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TROQ12816 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TROQ12816 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TROQ12816 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TROQ12816 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TROQ12816 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TROQ12816 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TROQ12816 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TROQ12816 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TROQ12816 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TROQ12816 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TROQ12816 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TROQ12816 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TROQ12816 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TROQ12816 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TROQ12816 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TROQ12816 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TROQ12816 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TROQ12816 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TROQ12816 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TROQ12816 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TROQ12816 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TROQ12816 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TROQ12816 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TROQ12816 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TROQ12816 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TROQ12816 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TROQ12816 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TROQ12816 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TROQ12816 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TROQ12816 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TROQ12816 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TROQ12816 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TROQ12816 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TROQ12816 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TROQ12816 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TROQ12816 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TROQ12816 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TROQ12816 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TROQ12816 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TROQ12816 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TROQ12816 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TROQ12816 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TROQ12816 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TROQ12816 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TROQ12816 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TROQ12816 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TROQ12816 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TROQ12816 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TROQ12816 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TROQ12816 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TROQ12816 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TROQ12816 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TROQ12816 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TROQ12816 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TROQ12816 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
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