Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FOXO1Q12778 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FOXO1Q12778 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FOXO1Q12778 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXO1Q12778 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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