Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TGM3Q08188 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM3Q08188 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms