Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CD164Q04900 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CD164Q04900 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms