Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMX1Q04741 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms