Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GBE1Q04446 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GBE1Q04446 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms