Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 CRABP2-203ENST00000368222 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AL513285.1-201ENST00000423187 432 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AL050343.1-203ENST00000586761 1290 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AL627171.2-201ENST00000635177 1090 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 TMOD2-202ENST00000435126 1490 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 UGT2B7-205ENST00000622664 1532 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AL732372.2-201ENST00000431321 437 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 ATP6AP2-204ENST00000447485 1254 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNB1Q02641 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms