Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POU5F1Q01860 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms