Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms