Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD3P84022 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD3P84022 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms