Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms