Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJA9P57773 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJA9P57773 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJA9P57773 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GJA9P57773 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms