Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASP9P55211 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASP9P55211 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP9P55211 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP9P55211 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms