Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCR4P51679 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCR4P51679 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCR4P51679 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms