Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RORCP51449 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RORCP51449 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RORCP51449 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RORCP51449 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RORCP51449 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RORCP51449 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RORCP51449 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RORCP51449 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RORCP51449 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RORCP51449 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RORCP51449 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RORCP51449 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RORCP51449 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms