Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA4P48169 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms