Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATRXP46100 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATRXP46100 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRXP46100 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms