Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAD52P43351 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms