Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIA2P42262 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms