Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORAP35398 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORAP35398 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORAP35398 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORAP35398 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORAP35398 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORAP35398 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORAP35398 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RORAP35398 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RORAP35398 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORAP35398 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORAP35398 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORAP35398 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORAP35398 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORAP35398 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORAP35398 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORAP35398 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORAP35398 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORAP35398 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms