Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRMP28827 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRMP28827 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
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