Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR2AP28223 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms