Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms