Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LAMA1P25391 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms