Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRDP23468 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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