Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MSR1P21757 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MSR1P21757 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MSR1P21757 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MSR1P21757 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MSR1P21757 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MSR1P21757 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MSR1P21757 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MSR1P21757 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MSR1P21757 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSR1P21757 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MSR1P21757 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MSR1P21757 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSR1P21757 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MSR1P21757 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSR1P21757 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSR1P21757 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSR1P21757 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSR1P21757 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSR1P21757 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MSR1P21757 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSR1P21757 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSR1P21757 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSR1P21757 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSR1P21757 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MSR1P21757 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSR1P21757 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MSR1P21757 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MSR1P21757 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSR1P21757 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms