Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms