Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF3P18847 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF3P18847 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF3P18847 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF3P18847 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF3P18847 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF3P18847 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF3P18847 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF3P18847 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF3P18847 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF3P18847 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF3P18847 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF3P18847 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF3P18847 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF3P18847 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF3P18847 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF3P18847 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF3P18847 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF3P18847 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF3P18847 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms