Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACADSP16219 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACADSP16219 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACADSP16219 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACADSP16219 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACADSP16219 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACADSP16219 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACADSP16219 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms