Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM1P13688 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms