Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL3P10147 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL3P10147 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL3P10147 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3P10147 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms