Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJB1P08034 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJB1P08034 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB1P08034 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB1P08034 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB1P08034 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB1P08034 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB1P08034 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB1P08034 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB1P08034 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB1P08034 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJB1P08034 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJB1P08034 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GJB1P08034 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms