Protein–RNA interactions for Protein: P02461

COL3A1, Collagen alpha-1(III) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL3A1P02461 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL3A1P02461 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms