Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRATO95237 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRATO95237 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms