Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JRKO75564 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JRKO75564 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms