Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC3O60481 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms