Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP9BO43861 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms