Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYNJ1O43426 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms