Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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HOXA3O43365 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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