Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CEP290O15078 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP290O15078 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP290O15078 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP290O15078 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP290O15078 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP290O15078 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP290O15078 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP290O15078 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP290O15078 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP290O15078 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP290O15078 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP290O15078 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP290O15078 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP290O15078 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP290O15078 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP290O15078 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CEP290O15078 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP290O15078 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP290O15078 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP290O15078 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP290O15078 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP290O15078 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP290O15078 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP290O15078 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP290O15078 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP290O15078 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP290O15078 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP290O15078 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP290O15078 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CEP290O15078 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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CEP290O15078 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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CEP290O15078 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CEP290O15078 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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