Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PATL2C9JE40 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PATL2C9JE40 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms