Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms