Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NBASA2RRP1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NBASA2RRP1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NBASA2RRP1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NBASA2RRP1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NBASA2RRP1 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NBASA2RRP1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NBASA2RRP1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NBASA2RRP1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NBASA2RRP1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NBASA2RRP1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NBASA2RRP1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NBASA2RRP1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NBASA2RRP1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms