Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F8A0AVK6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms