Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HIF3AQ9Y2N7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms