Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRTO4Q9UKD2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms